海关审计运作在最近几年取得了很大进步。满足了发展越来越快的商业活动。不同国家有不同的规定，各大领域的竞争加强要求公司不断提高组织水平。

海关审计的作用不仅在于敦促企业遵守规章制度，也有助于其了解实现便捷通关的办法。在公司信息流中增加对通关规定正确运用的分析，有助于预测通关诉讼风险。此外，程序优化也有助于实现规划经济与减少隐藏成本。